在海协会、海基会签署的《海峡两岸食品安全协议》框架下，海峡两岸食品安全专家于2011年8月30日-31日在浙江省杭州市召开了“第五届海峡两岸食品安全专家会议”，针对两岸食品安全领域相互关心的食品添加剂管理、新资源食品原料、保健食品管理、食品真菌毒素检测及“塑化剂”等问题进行了交流。会议在通报信息公开方式、新资源食品原料管理、食品真菌毒素检测等方面达成了共识，并确定了下届会议的有关内容。卫生部港澳台办、卫生部食品安全综合协调与卫生监督局、中国疾病预防控制中心、卫生部卫生监督中心等部门专家参加了会议。

两岸食品安全专家会议已经举办了5届，为两岸建立了畅通的食品安全信息沟通机制，会议涉及的领域不断深入扩大，涵盖了两岸民众在食品安全领域重点关注的问题，有力地推动两岸在食品安全管理方面的合作和交流。